miRNA熒光定量檢測服務(wù)，通常指基于實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)的成熟檢測方案，為客戶提供從樣本到數(shù)據(jù)分析的完整miRNA表達(dá)定量服務(wù)。其核心原理在于將微小的miRNA分子通過一系列精密步驟，轉(zhuǎn)化為可被熒光信號(hào)實(shí)時(shí)監(jiān)測并準(zhǔn)確定量的PCR產(chǎn)物。
第一步：高質(zhì)量RNA的提取與富集是成功的基石。由于miRNA片段小且易降解，提取必須能高效回收小RNA，并去除蛋白質(zhì)、基因組DNA等雜質(zhì)。服務(wù)通常采用專門的試劑盒，利用玻璃纖維濾膜或磁性珠特異性地結(jié)合小RNA，或通過有機(jī)萃取與選擇性沉淀進(jìn)行分離。對(duì)于血漿、血清等體液樣本，還需額外步驟去除高豐度的核糖體RNA并克服PCR抑制劑的影響。提取的RNA會(huì)經(jīng)過精密儀器進(jìn)行質(zhì)量檢測與定量，確保其純度和完整性滿足下游實(shí)驗(yàn)要求。
第二步：特異性逆轉(zhuǎn)錄是將miRNA轉(zhuǎn)化為穩(wěn)定cDNA的關(guān)鍵。由于miRNA長度極短，傳統(tǒng)的隨機(jī)引物或Oligo dT法無法適用。服務(wù)采用兩種主流策略。一是添加poly聚合酶在miRNA的3'末端加上一段通用序列，再使用與該序列互補(bǔ)的通用引物進(jìn)行逆轉(zhuǎn)錄。二是使用莖環(huán)結(jié)構(gòu)的特異性逆轉(zhuǎn)錄引物，其一段序列與特定miRNA的3'端互補(bǔ)，另一段形成延伸的通用序列。后者特異性較高，是區(qū)分高度同源miRNA家族成員的金標(biāo)準(zhǔn)方法。此步驟將不同的miRNA轉(zhuǎn)化為帶有共同引物結(jié)合位點(diǎn)的cDNA，為后續(xù)的通用PCR擴(kuò)增奠定基礎(chǔ)。
第三步：實(shí)時(shí)熒光定量PCR擴(kuò)增與檢測是實(shí)現(xiàn)精確定量的核心。以上一步獲得的cDNA為模板，在含有特異性上游引物、下游通用引物、DNA聚合酶和熒光報(bào)告系統(tǒng)的反應(yīng)體系中進(jìn)行PCR循環(huán)。特異性上游引物針對(duì)目標(biāo)miRNA的獨(dú)特序列設(shè)計(jì)。熒光檢測主要采用TaqMan探針法或SYBR Green染料法。TaqMan法使用一個(gè)與目標(biāo)序列互補(bǔ)、兩端分別標(biāo)記熒光報(bào)告基團(tuán)和淬滅基團(tuán)的探針，當(dāng)PCR延伸時(shí)探針被切割，報(bào)告熒光釋放，其信號(hào)強(qiáng)度與擴(kuò)增產(chǎn)物量成正比，特異性較強(qiáng)。SYBR Green法則是一種可嵌入雙鏈DNA的染料，其熒光強(qiáng)度與所有雙鏈DNA產(chǎn)物總量相關(guān)，經(jīng)濟(jì)但需通過熔解曲線分析確認(rèn)產(chǎn)物特異性。儀器實(shí)時(shí)監(jiān)測每個(gè)循環(huán)結(jié)束時(shí)的熒光強(qiáng)度，通過設(shè)定閾值，記錄每個(gè)反應(yīng)管內(nèi)熒光信號(hào)達(dá)到閾值所需的循環(huán)數(shù)。
第四步：數(shù)據(jù)歸一化與定量分析是獲得生物學(xué)結(jié)論的較后一步。由于樣本間RNA提取效率、逆轉(zhuǎn)錄效率存在差異，必須對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行歸一化校正。服務(wù)會(huì)檢測每個(gè)樣本中內(nèi)參基因的表達(dá)量，常用如U6 snRNA、miR-16等穩(wěn)定表達(dá)的小RNA。隨后，通過比較法，計(jì)算目標(biāo)miRNA相對(duì)于內(nèi)參基因的表達(dá)差異，較終以相對(duì)定量的形式呈現(xiàn)結(jié)果，例如“實(shí)驗(yàn)組中目標(biāo)miRNA的表達(dá)量是對(duì)照組的X倍”。
綜上所述，一項(xiàng)專業(yè)的miRNA熒光定量檢測服務(wù)，是分子生物學(xué)、流體力學(xué)、化學(xué)與信息學(xué)的精密融合。它通過標(biāo)準(zhǔn)化的操作流程、經(jīng)過驗(yàn)證的引物探針、嚴(yán)格的質(zhì)控體系以及專業(yè)的生物信息學(xué)分析，將痕量的miRNA轉(zhuǎn)化為可靠、可重復(fù)的表達(dá)數(shù)據(jù)，為基礎(chǔ)研究、生物標(biāo)志物發(fā)現(xiàn)與臨床診斷提供堅(jiān)實(shí)的數(shù)據(jù)支撐。
關(guān)注公眾號(hào)